Шуъба дар асоси ӯҳдадориҳои вазифавӣ ва барномаҳои илмӣ-таҳқиқотӣ анҷом додани таҳқиқоти масъалаҳои зеринро ба нақша гирифтааст:
- омӯзиши равандҳои динӣ-сиёсии ғайрисуннатии муосир дар Тоҷикистон ва таъсири он ба вазъи ҳаёти иҷтимоию сиёсӣ ва фарҳангии ҷомеа;
- дар асоси натиҷаҳои тадқиқоти сотсиологӣ муайян кардани сатҳи шуури динӣ ва мақому нақши дин дар ҳаёти иҷтимоию фарҳангӣ ва сиёсии ҷомеа;
- коркарди консепсияи исломшиносии муосир ва таҳқиқи роҳҳои баланд бардоштани маърифати динӣ ва ташаккули исломи мӯътадил;
- омӯзиши ҷанбаҳои гуногуни муносибати давлат ба дин ва иттиҳодияҳои динӣ ва муносибати фарҳангии давлати дунявӣ ба дин;
- хусусияти ифротгароӣ дар аҳком, сиёсат ва амалияи равияҳои динӣ-сиёсии ғайрисуннатӣ ва амнияти миллӣ;
- анъанаи дунявият дар фарҳанги давлатдории тоҷикон;
- суннатгароӣ ва модернизм дар исломи муосир;
- таносуби арзишҳои миллӣ ва динӣ дар ҷомеаи суннатии миллӣ ва нақши онҳо дар суботи ҷомеа ва таҳкими давлатдории миллӣ;
- нашри мақолаву асарҳои илмӣ доир ба масоили мубрами исломи муосир.